2019年11月14日 / 最終更新日 : 2019年11月14日 rbiology Bioinformatics RAxMLによる系統樹の作成 高速な最尤法による系統樹作成ツールRAxMLの使い方。インストール方法のほか、実際にMEGAを用いたモデルの探索、系統樹作成を実演。
2019年11月12日 / 最終更新日 : 2019年11月23日 rbiology Bioinformatics FastQCによる次世代シーケンスのクオリティチェック 次世代シーケンサーから出力されたリードのクオリティチェックをおこなうツールFastQCの使い方。アダプター配列やポリA配列の有無、クオリティの低いリードの割合を調べることができる。
2019年11月7日 / 最終更新日 : 2019年11月9日 rbiology Bioinformatics HISAT2を用いたリファレンスゲノムへのRNA-seqデータのマッピング RNA-seqデータの高速なマッピングツールHISAT2について。インストールからリファレンスゲノムへのマッピングまで
2019年11月4日 / 最終更新日 : 2019年12月13日 rbiology Bioinformatics SRA ToolkitによるSRAデータの取得 NCBIのSRAデータを取得するには SRA Toolkit を用いる。SRA Toolkit のインストールはこちら。 Accession ID の確認 まず、NCBIのSRAデータベースで目的のSRAファイルを検索し […]
2019年11月3日 / 最終更新日 : 2019年11月9日 rbiology Bioinformatics SRA Toolkitのインストール NCBIからSRAを取得するSRA Toolkitのインストール方法
